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類型分類:
科普知識
數據分類:
FFC連接器

通用型細菌16S rDNA 熒光定量PCR擴增檢測試劑盒說明書

發布日期:2022-04-17 點擊率:55

通用型細菌16S rDNA 熒光定量PCR擴增檢測試劑盒產品說明書

 

主要用途

 

通用型細菌16S rDNA 熒光定量PCR擴增檢測試劑是一種旨在運用SYBR綠色熒光染料作為標記信號,針對微生物樣本DNA進行保守性序列PCR擴增,實時檢測和定量分析擴增產物的而經典的技術方法。該技術經過精心研制、成功實驗證明的??梢员挥糜诟鞣N樣品,包括血液、體液、組織、土壤等的細菌拷貝數的定量檢測。產品即到即用,性能穩定,無核酶污染,操作便捷,敏感高效,定量準確,重復性強。

 

技術背景

 

16SrRNA作為非培養依賴性標記的分子指模(fingerprinting)技術,有別于傳統的選擇性培養技術,用于研究微生物的分類學(phylogenetics)。核糖體RNAribosome RNA)存在于所有微生物體內,且結構與功能進化保留;容易分離和識別;其一級和二級結構具有高度進化保守區域(conserved region)和物種特異性可變區域(variable region);其基因序列變異非常緩慢,且不會發生平行基因轉移(horizontal gene transfer)。其包括5S、16S、23S5S信息量不夠充分;23S不穩定;而微生物16SrRNA基因較為穩定,初級結構含有1500個堿基。通過引物設計,擴增產物。SYBR綠色熒光染料,作為DNA結合染料,可以和擴增子(amplican)上雙鏈DNA任一小溝minor groove)結合,而發出熒光信號。根據每一循環的熒光強度來確定擴增產物的產量,并用循環閾值(threshold cycle;Ct)表示,計算獲得拷貝數。

 

產品內容

 

反應液(Reagent A          300微升

染色液(Reagent B           20微升

引物液(Reagent C              40微升

補充液(Reagent D          500微升

封隔液(Reagent E          1.5毫升

產品說明書                 1

 

保存方式

 

保存在-20冰箱里;染色液(Reagent B避免光照;有效保證6

 

用戶自備

 

15毫升錐形離心管:用于樣品預處理的容器

1.5毫升離心管:用于預處理的容器

(微型)臺式離心機:用于樣品處理

PCR管:用于樣品擴增操作的容器

熒光定量PCR儀:用于熒光定量PCR反應

 

實驗步驟

 

實驗開始前,從-20冰箱中取出試劑,放進冰槽里融化。然后進行下列操作:

 

1. 一次反應總量為25微升

2. 移取15微升反應液(Reagent A0.5毫升PCR

3. 加入5微升待測的DNA模板(或 100納克)

4. 加入1微升染色液(Reagent B

5. 加入2微升引物液(Reagent C

6. 加入3微升補充液(Reagent D至總容量為25微升

7. 放進4微型臺式離心機瞬時離心5

8. 使用1000微升槍頭加入1封隔液(Reagent E(注意:參見注意事項10

9. 即刻放進熒光定量PCR

10. 熒光定量PCR反應程序為:

溫度(

時間

循環

95

2分鐘

1

95

55

72

30

90

60

 

40

72

5分鐘

1

11. 進行數據分析

(1) 采用比較閾值分析法(ΔΔCt),即相對定量,計算樣品拷貝數:建議使用用戶自備的對照樣品或大腸桿菌細菌株

(2) 或采用標準曲線法,即絕對定量,計算樣品拷貝數

(3) 細菌量單位計算:拷貝數/毫升樣品(copies/ml)或拷貝數/微克樣品DNAcopies/μg

A) 根據上述方法獲得待測樣品拷貝數(Q

B) 根據下列公式計算單位拷貝數,即拷貝數/毫升樣品(copies/ml)或拷貝數/微克樣品DNAcopies/μg

 

C單位拷貝數

Q:待測樣品拷貝數

VDNADNA萃取后的總容量

VPCR反應體系中DNA模板容量(5微升)

VEXT原始樣品總容量

 

注意事項

 

1. 本產品為20PCR反應

2. 操作時,須戴手套

3. 樣品操作注意生物安全

4. 本產品適合各種熒光定量PCR

5. 建議整個操作在4下進行

6. 建議使用帶濾芯的槍頭,避免交叉污染

7. 使用時,避免污染母液


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